Echo, Octavia und Diyoza gaben vor, auf der Seite der Jünger zu stehen. Cadogan zeigt Gabriel, Niylah und Jordan Protokolle, die von den einheimischen Bardoanern hinterlassen wurden und die wahrscheinlich denselben Effekt beschreiben, den Becca erlebte, als sie den letzten Codex in den Anomaliestein eingab; nach Bills Interpretation deuten die Protokolle darauf hin, dass der Sieg im letzten Krieg zur Erlangung der Transzendenz führen wird, der Quelle des Glaubenssystems der Jünger, während Jordan glaubt, dass die Sprache falsch übersetzt wurde und der Krieg in Wirklichkeit ein Test ist, um das Schicksal der Menschheit zu bestimmen. Die Jünger brauchen den Schlüssel, um den Code zu bestimmen, der eingegeben werden muss, um alles in Gang zu setzen, wissen aber nicht, dass die Flamme nicht mehr in Clarkes Kopf ist. Echo ist unterdessen dabei, sich für Bellamys Tod zu rächen, indem er die biologische Waffe Gen-9 freisetzt, um alle Jünger zu vernichten.
Obwohl Echo dank Raven ihre Meinung ändert, tötet Hope Anders und versucht, sie zu befreien; Diyoza opfert sich, um den Völkermord zu stoppen und seine Tochter und Freunde zu retten.
In Sanctum arbeitet Sheidheda daran, ihre Position zu festigen, indem sie den Wonkru ihre Wiederauferstehung offenbart und Indra in einem Kampf um die Clanführung besiegt, obwohl es Madi gelingt, den dunklen Kommandanten auf einem Auge zu blenden. Von Sheidheda und den Wonkru gejagt, versammelt Murphy die Überlebenden des Massakers unter seiner Führung, um sich zu verstecken und den Kampf gegen das Königreich vorzubereiten
Siebenundneunzig Jahre nach einer verheerenden nuklearen Apokalypse, die das meiste menschliche Leben auf der Erde ausgelöscht hat, leben Tausende von Menschen in einer Raumstation, die die Erde umkreist und die sie Arche nennen. Drei Generationen wurden im Weltraum geboren, doch als die Lebenserhaltungssysteme auf der Arche zu versagen beginnen, werden einhundert jugendliche Häftlinge zur Erde geschickt, um in einem letzten Versuch festzustellen, ob sie bewohnbar ist, oder um zumindest die Ressourcen für die verbleibenden Bewohner der Arche zu retten. Sie entdecken, dass einige von ihnen die Apokalypse überlebt haben: die Grounders, die in Clans leben, die in einen Machtkampf verwickelt sind; die Reapers, eine andere Gruppe von Grounders, die von den Mountain Men in Kannibalen verwandelt wurden; und die Mountain Men, die in Mount Weather leben und von denen abstammen, die sich vor der Apokalypse eingeschlossen haben. Unter der Führung von Clarke und Bellamy versuchen die Jugendlichen, die harten Bedingungen auf der Oberfläche zu überleben, feindliche Erdlinge zu bekämpfen und die Kommunikation mit der Arche herzustellen.
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